華大基因家蠶超級(jí)泛基因組研究成果入選國(guó)內(nèi)十大科技新聞

2023-01-11 10:37:21來(lái)源：財(cái)訊界

隨著基因科技的不斷發(fā)展,科學(xué)家運(yùn)用先進(jìn)的基因測(cè)序技術(shù)開展跨領(lǐng)域泛基因組研究,基因科技助力創(chuàng)新成果層出不窮

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近日,中央廣播電視總臺(tái)正式發(fā)布2022年度國(guó)內(nèi)、國(guó)際十大科技新聞,其中,由西南大學(xué)家蠶基因組生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任、國(guó)家蠶桑產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席科學(xué)家代方銀教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合華大基因等單位合作完成的家蠶超級(jí)泛基因組項(xiàng)目入選2022年度國(guó)內(nèi)十大科技新聞

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研究團(tuán)隊(duì)基于華大基因自主研發(fā)的時(shí)空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq,對(duì)1078份蠶種質(zhì)資源進(jìn)行了深度短讀長(zhǎng)測(cè)序,并對(duì)其中545份代表性資源進(jìn)行了長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序,產(chǎn)生55.57T基因組數(shù)據(jù),組裝了545個(gè)蠶的高質(zhì)量基因組,對(duì)100個(gè)基因組進(jìn)行了基因注釋,鑒定到4,300余萬(wàn)個(gè)SNP、930余萬(wàn)個(gè)Indel

、340余萬(wàn)個(gè)結(jié)構(gòu)變異(SV)和7,308個(gè)新基因(家族),繪制了一個(gè)世界首張千蠶高精度家蠶泛基因組圖譜,助力人類構(gòu)建泛基因組,賦能未來(lái)作物育種

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中國(guó)科學(xué)家繪制完成世界首張千蠶高精度基因遺傳變異圖譜

近年來(lái),單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,使得研究團(tuán)隊(duì)從單個(gè)細(xì)胞中獲得大量的轉(zhuǎn)錄組、表觀遺傳和蛋白質(zhì)組學(xué)信息

。能夠幫助細(xì)胞的基因表達(dá)信息和空間信息一一對(duì)應(yīng)的空間組學(xué)技術(shù)則成為了2022年最值得關(guān)注的七大年度技術(shù)之一

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華大基因作為基因行業(yè)的奠基者,致力于通過(guò)基因檢測(cè)、質(zhì)譜檢測(cè)

、生物信息分析等多組學(xué)大數(shù)據(jù)技術(shù)手段,為科研機(jī)構(gòu)

、企事業(yè)單位、醫(yī)療機(jī)構(gòu)

、社會(huì)衛(wèi)生組織等提供研究服務(wù)和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)檢測(cè)綜合解決方案

。2021年初,華大基因重磅發(fā)布其自主研發(fā)的時(shí)空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq。該技術(shù)通過(guò)時(shí)空捕獲芯片,結(jié)合原位RNA捕獲,實(shí)現(xiàn)了500 nm的分辨率,同時(shí)捕獲面積可達(dá)13cm x 13cm,成為全球首個(gè)同時(shí)實(shí)現(xiàn)“納米級(jí)分辨率”和“厘米級(jí)全景視場(chǎng)”的技術(shù)

。

被譽(yù)為新時(shí)代分子“顯微鏡”的Stereo-seq技術(shù),自發(fā)布以來(lái),為人類重新認(rèn)知器官結(jié)構(gòu)

、生命發(fā)育、物種演化和定義人類疾病提供了底層工具,持續(xù)創(chuàng)造生命科學(xué)領(lǐng)域的多項(xiàng)突破性研究

。在繪就世界首張千蠶高精度基因遺傳變異圖譜之前,該項(xiàng)技術(shù)助力繪就小鼠器官發(fā)生圖譜

、斑馬魚胚胎發(fā)生過(guò)程中基因表達(dá)全景圖譜及發(fā)育軌跡的時(shí)空映射、果蠅胚胎和幼蟲發(fā)育的高分辨率3D時(shí)空轉(zhuǎn)錄組圖譜等多項(xiàng)泛基因組項(xiàng)目研究

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華大基因助力科研團(tuán)隊(duì)繪就千蠶高精度基因遺傳變異圖譜之外,還率先完成家蠶基因庫(kù)數(shù)字化的構(gòu)建,對(duì)于深化功能基因組研究和推動(dòng)家蠶模式化,開啟家蠶設(shè)計(jì)育種,賦能“改造家蠶

、多元利用”等方向?qū)⑻峁┲匾目茖W(xué)支撐

。未來(lái),華大基因?qū)楦嗫蒲袌F(tuán)隊(duì)提供時(shí)空組學(xué)等多專業(yè)基因測(cè)序技術(shù)與服務(wù),破解物種培育密碼,助力多領(lǐng)域物種育種。

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